一人で楽しめるストーリーから、複数でライバルとしのぎを削るネットワーク対戦まで、本作の魅力満載の充実したゲームモードを満喫しよう！
原作小説版『とある魔術の電脳戦機』後の物語が語られるゲームモード。
学園都市で開催されるバーチャロンの大会を舞台に、それぞれのキャラの視点での物語が描かれる。
プレイを進めるにつれて新たなキャラのエピソードが開放され、学園都市で起きた事件の真相が明らかになっていく。。
インターネットにつないで、全国のプレイヤーと対戦できるゲームモード。
戦績が残り、本気の腕試しが可能な「ランクマッチ」と、自由な設定で気軽に対戦できる「プレイヤーマッチ」が存在。
自分のプレイをリプレイデータに保存して、あとで見返すことも可能だ。操作に慣れてきたら、ぜひオンラインプレイにもチャレンジ！
試合をしていないプレイヤーには、試合を観戦できる観戦モードも存在！ライバルの動きを分析しよう！
小萌先生より手取り足取り教えてもらえるチュートリアルモード！
初めての人でも全ての操作方法を、小萌先生に一から教えてもらえるので、プレイにすぐに慣れることができる！
自分と相手の機体の状態を自由に設定して、バーチャロイド操作の練習ができるモード。
ダッシュやトランジションなど基本操作の反復練習から、細かな武装の性能確認まで、幅広く活用できる。設定ではブーストゲージを満タンにもできるので、実戦では確認が難しい各機体のブースト・ウェポンの性能チェックの際にもオススメだ。
ターミナルでは、オンライン対戦の前に表示されるパーソナルカードの編集や、各種データの確認などができる。ゲーム内で入手したリソースを使えば、各種イラストやボイス、ＢＧＭといった、ファンにはうれしいコレクション要素を開放することも可能だ。
